DNA測序的原理和步驟
DNA序列測定分手工測序和自動(dòng)測序,手工測序包括Sanger雙脫氧鏈終止法和Maxam-Gilbert化學(xué)降解法。自動(dòng)化測序實(shí)際上已成為當今 DNA序列分析的主流。
ABI PRISM 310型基因分析儀(即DNA測序儀),采用毛細管電泳技術(shù)取代傳統的聚丙烯酰胺平板電泳,應用四色熒光染料標記的ddNTP(標記終止物法),因此通過(guò)單引物PCR測序反應,生成的PCR產(chǎn)物則是相差1個(gè)堿基的3末端為4種不同熒光染料的單鏈DNA混合物,使得四種熒光染料的測序 PCR產(chǎn)物可在一根毛細管內電泳,從而避免了泳道間遷移率差異的影響,大大提高了測序的精確度。由于分子大小不同,在毛細管電泳中的遷移率也不同,當其通過(guò)毛細管讀數窗口段時(shí),激光檢測器窗口中的CCD(charge-coupled device)攝影機檢測器就可對熒光分子逐個(gè)進(jìn)行檢測,激發(fā)的熒光經(jīng)光柵分光,以區分代表不同堿基信息的不同顏色的熒光,并在CCD攝影機上同步成像,分析軟件可自動(dòng)將不同熒光轉變?yōu)镈NA序列,從而達到DNA測序的目的。分析結果能以凝膠電泳圖譜、熒光吸收峰圖或堿基排列順序等多種形式輸出。